有机产品在整个生产过程中严禁使用合成肥料、农药、辐照、激素、抗生素、转基因成分等。在产品安全指标方面，有机产品指标更严格，如欧盟和美国有机标准要求不得检出农药残留，而常规产品可能含有农药残留。常规农业种植依靠化学干预来防治害虫和杂草，并为植物提供营养，而有机种植则依靠生物多样性和堆肥等自然原理来生产健康食品，因此有机种植被认为是农业可持续发展和食品安全的有效方法。目前许多国家已经建立了有机产品标准，产品必须经过有机认证机构的认证，才能被贴上“有机”的标签。
在过去，由于提取物活性成分含量检测方法不完善，因此常以提取比来表明提取物的质量，提取比高通常被认为产品质量更好。从科学上讲，提取比作为提取物质量的衡量指标其价值有限，如果没有对活性成分进行分析测试，就无法知道15:1的提取物是否比8:1的提取物活性成分含量更高。因为食用菌原料可能存在较大差异，如不同产地、不同栽培方式的种植的食用菌会产生不同的活性成分，提取工艺的不同也会导致提取物质量的差异。同时提取比例也可能被歪曲，如新鲜食用菌通常含有90%的水分，所以干湿比是10:1，有些产品使用这个比例，称产品是10:1的提取物(10公斤新鲜食用菌=1公斤粉末)，而实际上只是1:1(1公斤干食用菌=1公斤粉末)。
随着科学的发展，不同食用菌的活性成分含量检测鉴定方法相继被建立。使用经过科学验证的活性成分含量作为质量评价指标更加科学，如β-葡聚糖、灵芝三萜、虫草素等。目前，基于消费者的习惯，很多产品名称中仍然使用提取比，但我们更应该关注其活性成分的含量。
植物提取物掺假是国际市场上普遍存在的问题，我们推荐以下方法给我们的客户来鉴定食用菌粉和提取物的纯度。食用菌中的活性多糖一般为β-葡聚糖，其α-葡聚糖含量一般较低(5%)。对于以多糖为活性成分指标的产品，添加无活性的淀粉、糊精可以提高多糖含量，但真正来源于食用菌的多糖含量则较低。
对于添加了淀粉类物质的产品可以采用碘实验进行定性鉴别。同时我们也建议采用Megazyme试剂盒来定量检测β-葡聚糖的含量，一般情况下食用菌菌丝体或者产品加入淀粉类辅料后，α-葡聚糖含量高，β -葡聚糖含量则偏低，而食用菌子实体产品中α-葡聚糖含量一般低于5%。此外需要注意的是，使用Megazyme试剂盒检测食用菌粉时，其β-葡聚糖含量通常高于食用菌提取物，这是因为食用菌粉同时含有水溶性和不溶性β-葡聚糖，而使用热水提取工艺生产的食用菌提取物只含有水溶性β -葡聚糖，其活性高于水不溶性β -葡聚糖。也就是说，食用菌提取物是水溶性的，而食用菌粉和大多数其他来源的β-葡聚糖是不溶于水的，如酵母β-葡聚糖。
此外，许多食用菌的基因序列已被破译，一些实验室已经开发出DNA条形码技术来识别植物或食用菌品种，通过ITS、tmH-psbA等DNA条形码片段序列比对可以识别出食用菌产品的真实来源。
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